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CELL重磅-单细胞测序揭示GBM异质性的关键因素

时间:2019-06-15 16:47:59

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CELL重磅-单细胞测序揭示GBM异质性的关键因素

胶质母细胞瘤的细胞状态模型及其遗传和微环境决定因素

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【Ref:Neftel C,et al., Cell 178, 1–15 August 8, .doi:10.1016/j.cell..06.024.】

研究背景

原发性胶质母细胞瘤(IDH野生型GBM)是最常见的颅内原发恶性肿瘤,预后极差。目前主要的治疗方法包括:手术切除,以及术后同步放化疗。尽管如此,GBM患者的中位生存时间仍低于20个月,5年生存率不足5%。治疗效果不佳的主要原因是肿瘤细胞的高度异质性。关于GBM的高异质性,早在前来自哈佛大学的团队,通过对近500例GBM患者基因表达谱的分析,发现可以依据其基因表达谱的不同,将GBM患者分为4种类型,分别是:神经元型(N),前神经元型(PN),经典(CL)和间充质(MES)。并且,不同类型的GBM患者对于治疗的反应也是不一样的,相较于其他类型的GBM患者,经典型GBM的治疗效果最佳。

随着单细胞基因测序技术的发展,我们对于疾病在基因水平的认识提升到了单个细胞水平。而这一进步优势,对于肿瘤异质性的研究至关重要。近期,在CELL上发表了题为An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma的研究成果,该研究通过对GBM肿瘤组织进行单细胞测序及相关分析和体内外验证实验,揭露了GBM异质性的关键因素。

研究方法

该研究通过对20例成年人GBM和8例儿童GBM样本进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq),同时整合TCGA 401例GBM患者的大体测序数据,发现在GBM中存在四种不同类型的细胞状态,而这是驱动GBM异质性的关键所在。接着,本研究从遗传物质和肿瘤微环境层面,对四种状态细胞之间的关系进行了探索研究;最后通过体外细胞、体内小鼠和PDX模型实验,进一步验证遗传和微环境因素是导致GBM的四种细胞状态异质性的主要驱动力。

研究结果

本研究发现,GBM中的恶性细胞主要存在四种不同的细胞状态,分别是:少突胶质祖细胞样、神经祖细胞样、星形细胞样和间质细胞样的状态。尽管在不同GBM患者中,四种状态细胞的比例各不相同。但是,这四种状态的细胞之间是可以相互转变的。也就是说,这些状态不同的细胞类型,受肿瘤微环境的影响,表现出极强的可塑性。此外,本研究发现这4种状态细胞也可以由同一种细胞转化而来。不同状态下细胞的分别受到基因CDK4,EGFR,PDGFRA及NF1的影响,因此,对这些基因状态的检测,有助于明确GBM中恶性细胞的状态。

研究结论

本研究阐明在GBM中存在四种状态的细胞,而这四类细胞可能是驱动GBM恶性本质的关键。同时发现,GBM中的特定遗传背景能够影响四种状态细胞的组成比例。该研究从单细胞水平对GBM的异质性进行了全新的阐述,为GBM的治疗提供新的理论依据。

参考文献

1. Neftel Cyril,Laffy Julie,Filbin Mariella G et al. An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma.[J] .Cell, , undefined: undefined.2. Verhaak Roel G W,Hoadley Katherine A,Purdom Elizabeth et al. Integrated genomic analysis identifies clinically relevant subtypes of glioblastoma characterized by abnormalities in PDGFRA, IDH1, EGFR, and NF1.[J] .Cancer Cell, , 17: 98-110.(阔然基因陈永武博士编译,复旦大学附属华山医院吴帅博士审校,复旦大学附属华山医院吴劲松教授终审)

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